院本部（位于青云谱区，迎宾北大道388号）

行政职能科室

     行政办公室、医务科、病案统计科、质控科（质量管理办公室）、护理部、门诊部、医院感染科、公共卫生科、医患关系办公室、预防保健科、财务科、核审科、人事科（人力资源管理办公室）、医保办、科教科、信息科、宣传科、麻防科、社会医疗科

党群职能科室

    党总支办公室、纪检监察室

后勤保障职能科室

    设备科、总务科、保卫科、爱卫办、膳食科（营养）、重大重点项目办公室

临床科室

    皮肤内科（真菌病科）、中西医结合科、皮肤外科、性病科、美容皮肤科

医技科室

    检验科（输血）、真菌（检验）科、医学影像科、特检科、病理科、康复理疗科（物理治疗、中医治疗）、手术室（麻醉科）、供应室、药剂科

 第二门诊部（位于东湖区，环湖路151号）

 康复中心（位于南昌县，迎宾南大道1892号）